数据采集


脑影像数据采集

一. 数据采集建议

1. 磁共振采集,建议选择3T磁共振,Siemens、GE、Philips和联影设备均可

(1)序列包括结构相(voxel size:1×1×1 mm3)、静息态(voxel size: 3.5 × 3.5 ×3.5 mm3)和DTI(voxel size: 2×2×2 mm³,64方向)。MRI采集时应包含受试者姓名全拼(小写)和系统产生的受试者编号。我们将从头文件中读取ID、姓名、性别、年龄、扫描日期、序列描述等信息。

(2)关于序列名称中关键词(大小写均可)推荐:T1结构像:T1;T2结构像:T2、FLAIR;功能像:BOLD、fMRI;静息态功能像:resting;弥散像:DTI、Diff、Diffusion;水模:Phantom。

2. PET数据采集,可选择18F-氟脱氧葡萄糖 (18F-FDG)、Aβ、Tau-PET成像。


二、数据上传

1. 网络上传,通过慧脑云搭建的前置机直接上传数据到中心平台;

2. 本地数据上传,支持DICOM和NIFTI数据(BIDS格式整理)上传,可将一个或多个受试者的所有序列数据压缩为ZIP,RAR,TAR.GZ 文件。登录到中心平台,通过网页直接上传压缩包;

3. 其他附件上传,例如任务态的任务程序及时序文件。





脑电数据采集

一. 数据采集建议

1. 采样率和滤波

•   建议:0.5-200 Hz,采样率不低于1000Hz

•   依据:

(1) 国际脑科学研究组织,如国际脑电联盟、加拿大临床神经生理学家学会等,建议高通小于1Hz,低通大于70Hz,采样率为滤波器截止频率的4倍以上;

(2)国际主流脑电采集系统,如美国Neuro Scan公司、BP公司、荷兰BIOSEMI公司等公司的脑电采集系统,采样率都支持1000Hz以上,带宽范围DC-400Hz以上。

2. 导联数目

   建议:不低于32导联,如果特别情况,可考虑16导

   依据:

(1) 建议在研究中使用75至256个电极用于头皮EEG记录。由于设备硬件限制和实验受试者数量庞大等实验条件限制,可缩减电极数量,但至少符合以下要求中所提到的25个记录位置;

(2)国际主流脑电采集系统,如美国Neuro Scan公司、BP公司、荷兰BIOSEMI公司等公司的脑电采集系统,支持通道数都在32通道以上;

(3)当前脑科学研究中,脑电实验通常采集的脑电也在32导联以上,可用于脑网络分析等。


二. 数据命名规则

脑电数据命名规则.png

1. ID:被试唯一编号,必填,可以是字母和数字组合;

2. Taskname:任务简称,必填,可以是英文、数字与常用字符组合,不能使用空格、@等特殊字符

3. n:第n次重扫,根据实际情况填写,若无则不需填写

4. Suffix:文件后缀,为系统自带,请勿修改。