数据质控

多模态脑影像数据质控

一. 场图、结构像、功能像和弥散像通用质量控制分项:

1. 序列完整性检查:检查DICOM 文件是否可以正确地解析并转换为NIfTI 文件,返回错误原因;对于不通过情况,具体解决方案为检查并重新推送;

2. 数据缺层检查:根据DICOM 到NIfTI 转换输出日志信息,检查数据转换后是否存在缺层情况,返回具体缺层信息;对于不通过情况,具体解决方案为检查并重新推送;

3. 序列参数检查:根据项目确定的扫描参数,读取DICOM 文件中对应信息,与引擎配置文件中所约定的序列参数进行匹配(可动态配置),报告序列参数是否一致,返回具体参数不一致结果;对于不通过情况,具体解决方案为核对序列参数并重新采集。

 

二. 量化指标的阈值选取规范:

1. 对于文献中有明确阈值的(如FD、离群值最大比例等),采用文献中推荐的阈值;

2. 对于没有明确阈值定义的(如efc、fber 等),如果其在公开数据集中计算过,则利用公开数据集上计算质量合格被试对于该指标的分布,进而在此基础上,采用一倍或两倍标准差定义阈值;

3. 对于完全没有依据的指标(如部分snr),需要根据预实验选取适应于本队列项目的阈值。





脑电数据质控

一、质控软件推荐:

1推荐MATLAB版本:2015a、2018b、R2020a;

2. 推荐操作系统版本:Windows10,Mac Monterey,Ubuntu16.04


二、量化指标的阈值选取规范

1. 当前支持转换的原始EEG数据文件来源:Neroscan(*.cnt)、Biosemi(*.bdf)、欧洲数据格式(*.edf)、通用数据格式(*.gdf)、BrainVision(*.vhdr)和EEGLAB(*.set);

2. 一般需要根据实际采集设备,填入脑电导联,其他参数一般默认。